关于被审计企业2019年12月31日银行存款余额调节表中“企业已付，银行未付”的调节项（以支票支付赊购材料款），以下哪些审计程序能为其提供有效审计证据？

对于被审计企业2019年12月31日的银行存款余额调节表中出现的“企业已付，银行未付”的调节项，内容为以支票支付赊购材料款的情况，审计程序需要提供相应的审计证据。

A选项检查付款申请单是否经适当批准，这只能为付款的真实性提供证据，并不能直接证明调节项中的“企业已付，银行未付”情况，因此A选项不正确。

B选项就2019年12月31日相关供应商的应付账款余额实施函证，这可以直接验证企业是否已支付赊购材料款，为调节项提供直接的审计证据。

C选项检查支票开具日期，如果支票开具日期在2019年12月31日之前，那么该支付应已反映在银行存款余额调节表中，这可以为调节项提供审计证据。

D选项检查2020年1月的银行对账单，如果银行在2020年1月确认了该笔支付，那么可以验证该笔支付的真实性及其时间，从而提供审计证据。

因此，能为该调节项提供审计证据的有BCD选项。