在审计过程中，注册会计师应当以书面形式与治理层沟通的事项是？

在审计过程中，注册会计师与治理层沟通的事项中，关于注册会计师的独立性应当以书面形式进行沟通。这是为了确保沟通的明确性和正式性，避免产生任何误解或疑问。其他选项如计划的审计范围和时间安排、审计中的重大发现以及审计中发现的内部控制缺陷，并不要求必须以书面形式进行沟通。因此，正确答案为D。