关于甲公司财务报表审计工作中A注册会计师的处理方式，判断其是否恰当。

基于上述题目内容，我们可以得出以下解析：

(1)对于第①项，甲公司的持续经营假设存在重大不确定性且在财务报表附注中未充分披露，这是一个重要的审计问题。A注册会计师仅仅计划在审计报告中增加强调事项段是不够的，还需要考虑这对审计意见的影响。如果这个问题导致审计意见重大，那么应该发表保留或否定意见。

(2)对于第②项，如果发现已审计的财务报表和其他信息（如公司年度报告）之间存在重大不一致，这是审计中的一个重要问题。A注册会计师不能简单地接受管理层的拒绝修改决定，而应该坚持要求管理层进行更正。如果管理层拒绝更正，那么应该与治理层沟通并考虑采取适当的措施，例如发表保留意见或无法表示意见。

(3)对于第③项，关于前任注册会计师审计的上期财务报表的情况，A注册会计师在其他事项段中应该详细说明。这包括说明上期财务报表已经其他会计师事务所审计、前任注册会计师发表的意见类型（例如无保留意见），以及前任注册会计师出具审计报告的日期。这样做有助于读者更好地理解本期财务报表的背景和与前任注册会计师的审计工作之间的关系。