在审计过程中，注册会计师应如何运用观察程序以确保控制的有效性？

在审计过程中，注册会计师运用观察程序以确保控制的有效性时，需要将观察与其他审计程序结合使用。观察程序可以单独使用，但提供的证据仅限于观察发生的时点，因此需要结合询问和检查相关的文件，以获得更多关于某一段时期内控制运行有效性的证据。因此，选项A正确。

对于选项B，检查程序适用于运行情况留有书面证据的控制，并不是适用于所有控制测试。因此B选项错误。

对于选项C和D，重新执行程序确实在无法获得充分证据时会被考虑，但并不是适用于所有控制测试。只有在询问、观察和检查程序结合在一起仍无法获得充分的证据时，注册会计师才会考虑实施重新执行程序来证实控制是否有效运行。因此C和D选项均错误。