下列各项中，属于注册会计师应当与被审计单位治理层沟通审计中发现的重大问题的有(  )。

本题考查注册会计师与被审计单位治理层沟通审计中发现的重大问题的内容。具体内容如下：

注册会计师应当与被审计单位治理层沟通审计中发现的重大问题，包括以下几个方面：

A. 注册会计师已与管理层书面沟通的重大事项：注册会计师在审计过程中会与管理层沟通一些重大事项，这些事项也需要与治理层进行沟通，以确保审计工作的透明度和准确性。

B. 审计工作中遇到的重大困难：注册会计师在审计过程中可能会遇到一些重大困难，这些困难需要与被审计单位治理层进行沟通，以便寻求支持和协助解决。

C. 注册会计师对被审计单位会计实务重大方面的质量的看法：注册会计师需要对被审计单位的会计实务质量进行评估，并将自己的看法与治理层进行沟通，以帮助治理层了解被审计单位的财务状况和风险管理情况。

D. 影响审计报告形式和内容的情形：如果审计过程中发现一些影响审计报告形式和内容的情形，注册会计师需要与治理层进行沟通，以确保报告的准确性和完整性。

因此，选项A、B、C、D均属于注册会计师应当与被审计单位治理层沟通审计中发现的重大问题的内容。