关于纳税人实际占用的土地面积确定方法，下列哪些选项是正确的？

关于纳税人实际占用的土地面积确定方法，选项A、B和C是正确的。具体解析如下：

A选项：尚未组织测量，但纳税人持有政府部门核发的土地使用证书的，以证书确认的土地面积为准。

B选项：由省、自治区、直辖市人民政府确定的单位组织测定土地面积的，以测定的面积为准。

C选项：尚未核发土地使用证书的，由纳税人申报土地面积，据以纳税，待核发土地使用证以后再作调整。

而D选项中提到“以税务机关核定的土地面积为准”，这并不符合相关法规的规定。因此，正确答案是A、B、C。