税务机关实施特别纳税调查时，下列哪类企业不是其重点关注的对象？

根据参考解析中的描述，税务机关实施特别纳税调查时，应当重点关注的企业不包括未按照规定进行关联申报或者准备同期资料的企业。因此，正确答案为B。其他选项如低于同行业利润水平的企业、存在长期微利的企业以及与低税国家（地区）关联方发生关联交易的企业都是税务机关实施特别纳税调查时应重点关注的企业类型。