甲公司2020年5月以500万元直接投资乙公司，占有乙公司15%股权，2022年乙公司因故被清算，清算前账面累计未分配利润和累计盈余公积合计400万元，甲公司分得600万元，甲公司申报企业所得税应确认的投资转让所得为（）。

甲公司在乙公司清算后分得的剩余资产为600万元，其中相当于乙公司累计未分配利润和累计盈余公积中按甲公司所占股份比例计算的部分应确认为股息所得。这部分金额为400万元×15%=60万元。因此，甲公司申报企业所得税应确认的投资转让所得为600万元减去已确认为股息所得的60万元，再减去初始投资成本500万元，最终金额为40万元。所以，甲公司申报企业所得税应确认的投资转让所得为40万元，选项D正确。