主管税务机关在追缴非居民企业应纳税款时，可以采取的措施有（）。

主管税务机关在追缴非居民企业应纳税款时，可以采取的措施包括：

A. 责令企业限期申报缴纳应纳税款。这是税务机关常用的措施之一，以确保企业按时履行纳税义务。

C. 从企业境内其他收入中追缴滞纳金和欠税。根据相关规定，当非居民企业未按时缴纳税款时，税务机关可以从其在境内的其他收入中追缴欠缴的税款及应缴纳的滞纳金。

D选项的描述符合上述规定中的措施。而B选项“扣留企业在海关报关通行前的货物”不属于税务机关在追缴税款时的常规措施，因此不选。