某农户2021年2月经批准占用耕地1000平方米，900平方米用于种植花卉，剩余100平方米用于非搬迁自建住宅该地区耕地占用税额25元/平方米，其应缴纳耕地占用税( )元。

根据税法规定，用于种植花卉的耕地不需要缴纳耕地占用税。而对于农村居民在规定用地标准以内占用耕地新建自用住宅的情况，可以按照当地适用税额减半征收耕地占用税。在这个例子中，剩余的100平方米用于非搬迁自建住宅，所以应缴纳的耕地占用税为100平方米乘以每平方米的税额25元，再乘以50%（减半征收），计算结果为1250元。因此，答案为A。