甲公司，作为国内大型农业生产资料集团，在实施横向和纵向一体化战略后，对各子公司实行预算管理。在2013年收购乙化肥厂并计划全面改变其经营策略的背景下，甲公司在启动2014年度预算编制工作时，应要求乙化肥厂采用何种预算方式编制？

甲公司在收购乙化肥厂后更换了其总经理和财务总监，并计划全面改变乙化肥厂的经营策略。在这种情况下，甲公司应要求乙化肥厂从零开始编制预算，即采用零基预算方式。零基预算是指在每一个新的期间必须重新判断所有的费用，不考虑过去的预算或实际数据。因此，本题答案为D。