甲省乙市丙医院使用丁药品企业生产的某抗菌药物，发生严重的不良反应，如该药品需要实施召回，制定召回计划并组织实施的主体是

药品上市许可持有人是药品召回的责任主体，负责制定召回计划并组织实施。在题目中，丁药品企业是药品的上市许可持有人，因此负责制定召回计划并组织实施的主体是丁药品生产企业。因此，正确答案为D。