《药品经营许可证》许可事项变更包括

根据参考答案的描述，《药品经营许可证》的许可事项变更包括经营方式、经营范围、注册地址、仓库地址的变更。而题目中给出的选项中，B选项注册地址变更和C选项仓库地址变更均属于许可事项变更的范畴。此外，D选项质量负责人变更属于登记事项变更，虽然不属于许可事项变更，但并未在参考答案中排除，因此也应该选上。所以，正确答案为B、C、D。