法律体系按照法律效力等级由高到低包括:法律、行政法规、部门规章、规范性文件等。下列依次为法律、行政法规、部门规章的是

考查药品管理法律体系和法律关系。根据题干对法律、行政法规、部门规章的定义和描述，正确的顺序应该是法律、行政法规、部门规章。选项A中的《疫苗储存和运输管理规范》不属于法律、行政法规或部门规章；选项B中的《医疗机构处方审核规范》不属于法规；选项C中的《医疗用毒性药品管理办法》表述不完整且不符合题干要求的顺序；而选项D中的《疫苗管理法》、《放射性药品管理办法》和《药品生产质量管理规范》分别属于法律、行政法规和部门规章，符合题干要求的顺序。因此，答案为D。