甲向乙采购一批野山菇并预付了货款。履行期届至，甲下落不明，乙将该批野山菇变卖后，将所得款项提交给当地公证机关以替代履行。乙的债务消灭的原因是（）

本题考查债务消灭的原因。
根据《民法典》第五百七十条：“债权人下落不明，债务人可以将标的物提存以消灭债务。提存是指由于法律规定的原因债务人难以向债权人履行债务时，债务人将标的物交给提存部门而消灭债务的制度”。本题中，乙作为债务人，由于甲下落不明无法向其履行交付野山菇的义务，于是将该批野山菇提存于公证机关以替代履行，从而消灭债务。因此，乙的债务消灭的原因是提存。所以选项C正确，而选项A“抵销”、选项B“混同”、选项D“免除”均不符合题意。