生态系统中的含氮库主要包括无机氮库和有机氮库。无机氮库存在于土壤、水体和大气中,而有机氮库则存在于动植物残体、微生物及其排泄物中。因此,非生物成分中含氮的库包括大气中的氮气、土壤中的无机氮和有机氮等,至少有三个。因此,答案为D,即含氮的库有三个或更多。