在某次会议中，甲、乙、丙三名专家分别来自科研部、教育部和国防部。根据以下信息，哪项关于他们所属部门的陈述一定为真？ （1）只有甲来自国防部时，乙才可能来自科研部或教育部。 （2）如果丙不在教育部，那么甲不在国防部。 （3）乙如果在国防部，则甲不在教育部。 （4）甲不在国防部，除非丙在科研部。

根据题干信息，我们可以按照逻辑关系进行推理：

首先，根据条件(2)和条件(4)，如果甲来自国防部，那么丙既来自教育部又来自科研部，这是不可能的，因此甲不可能来自国防部。

然后，由于甲不可能来自国防部，根据条件(1)，乙只能来自科研部或教育部。但由于条件(3)告诉我们如果乙来自国防部，那么甲不能来自教育部，结合前述推理得出的甲不来自国防部，那么乙只能来自科研部。因此选项D正确。但由于问题是要求选出一定为真的选项，而题目给出的答案选项中并没有关于乙的部门选择，所以我们暂时不考虑乙的部门选择问题。

接着，由于甲不来自国防部，根据条件(3)，甲只能来自教育部或者科研部。但是，如果甲来自科研部，那么丙只能来自教育部（根据条件(1)），但此时又会导致条件(2)（¬丙教育→¬甲国防）与已知事实矛盾。因此甲只能来自教育部。因此选项B正确。同时因为已知甲来自教育部，所以选项A（甲来自科研部）是错误的。
关于丙的部门选择问题，由于已知甲和乙的部门选择已经确定，剩下的只有国防部的位置留给丙了。因此选项E（丙来自科研部）是错误的。所以最终答案是选项B（甲来自教育部）。