这里有一个控制农业杂草的新办法，它不是试图合成那种能杀死特殊野草而对谷物无害的除草剂，而是使用对所有植物都有效的除草剂，同时运用特别的基因工程来使谷物对除草剂具有免疫力。
下面哪项如果正确，将是以上提出的新办法实施的最严重障碍?

题干描述的新办法是通过使用对所有植物都有效的除草剂，同时运用基因工程使谷物对除草剂具有免疫力，以达到控制农业杂草的目的。针对各选项分析如下：

A选项提到某些特定除草剂对作物生长有阻碍作用，这与新办法中使用对所有植物有效的除草剂不矛盾，不构成障碍。

B选项关于基因重组对农作物营养成分的影响，与杂草控制方法的实际效果无直接关系，不构成障碍。

C选项指出某些除草剂对家禽、家畜及野生动物有害，这涉及除草剂的生态安全性问题，但题干并未明确提及这一点作为新办法的障碍。

D选项指出万能除草剂的万能作用可能不适合作为农业控制杂草的方法，这与题干描述的通过基因工程使谷物对除草剂具有免疫力不矛盾，不构成障碍。

而E选项指出基因重组后的谷物虽然单个植株可以免受除草剂影响，但其产出的种子因受除草剂影响而不发芽，这直接影响了农作物的种植和繁殖，使得新办法无法实施。因此，这是实施新办法的最严重障碍。