I didn't know why quite a few students were absent ______ class yesterday.

句子中的关键词组是"be absent from"，这是一个固定搭配，表示“缺席，缺少”。根据句意“昨天我不知道为什么有很多学生缺课”，应该选择A选项“from”，表示缺课是从某个地方缺席，如缺课堂。其他选项to、for、with与absent搭配使用不太合适。