项目的需求文档应精准描述要交付的产品，应能反映出项目的变更。当不得不作出变更时，应该（ ） 对被影响的需求文件进行处理。

根据题目描述，项目的需求文档应能反映出项目的变更，并且在不得不作出变更时，应该按照从高层到低层的顺序对被影响的需求文件进行处理。这是因为高层需求通常涵盖了项目的整体目标和架构，而低层需求则更具体地描述了实现这些目标所需的细节和功能。因此，从高层到低层的顺序处理变更可以更好地确保项目的整体方向和结构不会受到太大影响，同时也能逐步处理具体的功能变更。所以正确答案是C。