信息系统设备供应商在与业主单位签订采购合同前，因工期要求，已提前将所采购设备交付给业主单位，并通过验收。补签订合同时，合同的生效日期应当为（29）。

根据《中华人民共和国合同法》的相关规定，合同的生效日期应当以合同实际签订日期为准。虽然在此情况下设备已经交付并通过验收，但合同实际签订日期仍然是合同生效的法定时间节点。因此，补签合同时，合同的生效日期应当为合同实际签订日期。所以正确答案为D。