项目经理在6月1日对一个软件开发项目进行了挣值分析，项目CPI是1.0，进度偏差是0，在6月3日，附近的河流泛滥，致使开发计算机机房被淹，导致所有工作停工两周时间。该项目遭受了 （ ） 。

根据题干描述，项目经理在6月1日进行挣值分析时，并未提及附近河流泛滥的风险情况，但在6月3日发生了河流泛滥导致开发计算机机房被淹，造成项目停工两周。这表明风险的发生是已知的（因为河流存在，有可能发生洪水），但具体时间和情况是不可预测的。因此，该项目遭受的风险属于已知的不可预测风险。所以答案是B。