某系统集成项目初验完成后，按照合同约定，甲方应向乙方支付第二笔合同款，为此该项目的项目经理向监理单位递交了《付款申请》，则 （ ） 。 

《付款申请》是系统集成项目中的一个重要文件，涉及到合同款项的支付。按照合同约定，该文件的签字应该是由总监理工程师进行签字，以确保文件的正式性和有效性。因此，选项A正确，其他选项不符合合同约定和常规操作。