李先生是某软件开发公司负责项目的项目经理，该项目已经完成了前期的工作进入了实现阶段，但用户提出要增加一项新的功能，李先生应该 （ ） 。

根据题目描述，用户提出了一项新的功能需求，作为项目经理的李先生应该通过变更控制过程管理该变更。这是因为变更控制过程是一种规范化的管理方式，可以确保项目在发生变更时仍然能够有序进行，避免混乱和不必要的风险。因此，正确答案是C。