系统集成项目完成了需求分析阶段的工作并开发了原型系统，承建方应组织本方项目经理、建设方代表和相关干系人完成 （ ） 工作。

根据题目描述，系统集成项目已经完成了需求分析阶段并开发了原型系统，这意味着项目已经到达了一个重要的里程碑节点。在信息系统项目中，达到这样的里程碑节点后，通常需要进行正式的阶段评审，以确保项目进展符合预期，并对下一阶段的工作进行规划和安排。选项D“阶段评审”正是符合这一要求的正式评审过程。因此，承建方应组织本方项目经理、建设方代表和相关干系人完成阶段评审工作。