下列选项中， （ ） 是最安全的信息系统。

根据题目描述，ERP和CRM是集成化的信息系统，MRPII主要是制造资源计划系统，而MIS+S是初级信息安全保障系统。而S-MIS是建立在PKI/CA标准基础上的信息安全保障系统，因此被认为是最安全的信息系统。所以正确答案是D。