系统架构设计中，计算机作为工具对系统的结构、要素以及反馈等进行分析，旨在实现最优的______和______。

本题考查对系统工程基本概念的理解。

第一个空格，根据系统工程的定义，这里应该是对系统的结构、要素进行分析，故选项B“设计”符合题意。

第二个空格，系统工程的目的包括最优规划、最优设计、最优管理和最优控制，所以这里填“处理”不太准确，应该是一个更广泛的概念，但鉴于提供的选项中并没有更合适的词汇，故暂且选择D“处理”。

综上，答案为B和D。