系统工程运用计算机工具分析系统的结构、（ ）以及反馈信息，旨在实现最优规划、最优（ ）。

题目中提到系统工程利用计算机作为工具对系统的结构、要素、信息和反馈等进行分析，以达到最优规划、最优设计、最优管理和最优控制的目的。根据这一描述，可以明确知道在括号中应该填入的是与系统结构相关的内容，而“要素”是描述系统结构的一个重要方面，因此正确答案为D。