在计算机系统性能评估中，如何考虑各类指令在程序中的比例以及I/O结构、操作系统、编译程序等因素来准确评估系统性能？

等效指令速度法考虑了各类指令在程序中所占的比例，而基准程序法不仅考虑了CPU（包括主存）的性能，还综合考虑了I/O结构、操作系统、编译程序的效率等对系统性能的影响。因此，基准程序法能够更为准确地评估计算机系统的实际性能。所以答案是D。