采用三级模式结构的数据库系统中，如果对一个表创建聚簇索引，那么改变的是数据库的（2)。

在三级模式结构的数据库系统中，创建聚簇索引实际上是对数据的物理存储结构进行调整和优化。聚簇索引会改变数据的物理存储顺序，因此涉及到的是数据库的内模式，即物理存储结构。所以正确答案是C，内模式。外模式、模式和用户模式都与数据的逻辑结构或用户视图相关，而不是物理存储结构。