在EPON应用中，如果用户端的家庭网关或者交换机是运营商提供并统一进行VLAN管理的，那么在UNI端口上VLAN操作模式应该配置为(56）。

在EPON应用中，如果用户端的家庭网关或者交换机是运营商提供并统一进行VLAN管理的，那么在UNI端口上VLAN操作模式应该配置为VLAN透传模式。这是因为运营商需要进行统一的VLAN管理，透传模式可以确保VLAN信息在传输过程中不被修改，从而保证网络的稳定性和安全性。其他选项如VLAN标记模式、VLAN Translation模式等，在运营商统一VLAN管理的情况下可能不适用。因此，正确答案是B。