在信息系统体系架构总体参考框架中，哪一层次是组织实现信息化、数字化的基础部分，相当于运行管理层，为其他两层提供计算、传输、数据等支持？

根据题目描述，在信息系统体系架构总体参考框架中，信息基础设施是组织实现信息化、数字化的基础部分，相当于运行管理层。它为其他两层的系统提供计算、传输、数据等支持，是组织信息化的重要基石。因此，正确答案为D。