在项目变更管理中,项目经理负责变更申请的影响分析。其他选项中,变更申请提出者主要是提出变更需求,变更管理者负责变更的管理流程,变更控制委员会负责审批变更,而项目经理则需要负责召开变更控制委员会会议、监控变更及批准变更的正确实施等。因此,项目经理是负责变更影响分析的主要责任人。