假设用户 Q1 有 2000 台主机，如果分配给用户 Q1 的超网号为 200．9．64．0，则指定 Q1 的地址掩码为（54）。

根据题目给出的超网号 200.9.64.0，我们可以确定这是一个B类地址的子网划分。在B类网络中，子网掩码的设置与网络规模有关。对于较大的网络规模，需要保留更多的主机位以满足需求。在这个例子中，有大量的主机（超过一个子网所能容纳的数量），因此需要划分更多的子网位。在这种情况下，最合适的子网掩码是保留前三个数段的大部分位数不变，只改变主机位数最多的那段地址的一部分位数作为子网位数。因此，选择掩码为 255.255.248.0 可以满足需求，同时允许足够的子网划分和主机数量。所以答案是C。