关于计算机系统软件配置管理规程，下列哪些内容必须明确规定？ ①各级、各库中所管的软件实体的清单 ②保证安全性、可靠性的工作方针 ③入库控制办法和审批手续 ④出库条件及其必备的手续 ⑤变更控制办法和审批手续

根据给出的参考答案和题目描述，软件配置管理规程应该至少包括五个方面的规定。其中，各级、各库中所管的软件实体的清单、入库控制办法和审批手续、出库条件及其必备的手续以及变更控制办法和审批手续都是必须明确规定的。而保证安全性、可靠性、保密性、正确性、完备性、一致性和可追踪性的具体措施虽然没有直接列出，但从参考答案的描述中可以推断出其重要性，因此也应该被包括在内。因此，正确答案是D，即包括①、③、④、⑤四个方面的规定。