监理工程师在实施阶段进行进度控制，当发生阶段性工程延期，并造成总工期延迟时，可以（  ）。

根据提供的信息和参考答案，在处理工程延期时，监理工程师需要与建设单位和承建单位协商，并受理承建单位的工程延期申请。当阶段性工程延期导致总工期延迟时，监理工程师应要求承建单位修改总工期。修改后的总工期需要经过审核，并报经建设单位批准备案。因此，正确答案是C，即要求承建单位修改总工期，并经建设单位批准。