在某电子政务系统建设过程中， （10） 是恰当的处理方式。

本题考查对于电子政务系统中不同岗位的工程师的职责的掌控情况。
A选项中提到公司技术总监调换被投诉的监理工程师，这不恰当，因为调换人员的职责通常是总监理工程师的职责。
B选项中提到总监理工程师代表根据合同签发支付证书，这也不恰当，因为签发支付证书同样是总监理工程师的职责。
C选项提到监理辅助人员对采购的网络设备联调测试进行监督和记录，这是恰当的处理方式，因为监理辅助人员应该参与和监督相关的测试工作。
D选项中专业监理工程师负责编写监理细则并交叉审批，虽然编写监理细则是专业监理工程师的职责，但题目中并没有涉及到交叉审批的部分，所以不完全准确。
综上所述，恰当的处理方式是C选项，即监理辅助人员对采购的网络设备联调测试进行监督和记录。