在Linux系统中,设置文件访问权限的命令是"chmod"。该命令用于控制用户对文件的访问权限,包括读取、写入和执行权限。其他选项如"chgroup"是用于更改用户的属组,"su"是用于切换用户,"cd"是用于切换目录,均不符合题目的要求。