根据提供的工程进度计划图，到5月31日检查时，已完成、已开始但未完成以及尚未开始的作业数分别是？

根据提供的进度计划图，我们可以按照以下方式进行分析：

1. 在5月31日这一天，我们沿着横坐标找到这一天并在这条线上向上画一条竖线，以观察各个作业的进度情况。
2. 对于作业A，可以看出在5月31日时已经开始但尚未完成。
3. 对于作业B，可以看出在5月31日之前已经完成了。
4. 对于作业C和D，同样在5月31日已经开始但尚未完成。
5. 对于作业E，在5月31日时还未开始。

综上，到5月31日检查时，已完成作业数为1个（作业B），已经开始但尚未完成的作业数为3个（作业A、C、D），尚未开始的作业数为1个（作业E）。因此，正确答案为B。