在计算机组装过程中，采用多个品牌部件进行组装后，所有部件均表现正常，且连接、安装、配置操作无误，但系统仍然无法正常运行。最可能的原因是：

在计算机组装过程中，即使每个部件都正常，连接、安装、配置操作也完全正确，系统仍可能因部件之间的不兼容问题而不能正常使用。因此，很可能是不兼容问题。选项C中的“不兼容”描述了这种情况。其他选项如不稳定、不可靠或不安全虽然也可能导致系统无法正常使用，但在本题描述的情境下，不兼容是最可能的原因。