关于基金管理公司内部控制的原则和构成，以下哪项描述是正确的？

关于基金管理公司内部控制的原则和构成的问题，A项描述内部控制原则遗漏了健全性、有效性、独立性、相互制约性，B项描述内部控制原则遗漏了合法性、合规性，C项描述的公司内部控制机制层次数量错误，应为四个层次。而D项正确地描述了公司内部控制制度的构成，包括内部控制大纲、基本管理制度、部门业务规章、业务操作手册等部分。因此，正确答案为D。