在私募股权投资基金运作中，投资机构通过参与以下哪一方的相关会议来了解与公司发展相关的信息并保护股权投资基金的利益？

在私募股权投资基金运作中，投资机构通过参与被投资企业的相关会议，如股东大会、董事会和监事会，来了解与公司发展相关的信息。这是投资机构行使股东权利、了解公司经营状况、保护股权投资基金利益的重要渠道。因此，选项B“被投资企业”是正确的。