随着我国新三板市场的兴起和相关交易制度的完善，股权投资基金的主要退出方式是什么？

随着我国新三板市场的兴起和相关交易制度的日趋完善，新三板挂牌退出成为股权投资基金的重要退出方式。因此，选项D是正确答案。其他选项如清算退出、股权转让退出和IPO也是股权投资基金的退出方式，但题目中特别强调是新三板市场的兴起和交易制度的完善使得新三板挂牌退出变得更为重要。