关于未上市企业股权的非公开协议转让，以下表述正确的是（  ）

关于未上市企业股权的非公开协议转让，表述正确的是员工收购（EBO）是回购退出的一种方式。

解析如下：

A选项，并购退出、回购退出是协议转让退出的主要方式，但清算退出并不是协议转让的退出方式，所以A选项错误。

B选项，根据《公司法》规定，有限责任公司股权的外部转让，除公司章程另有约定外，需要征得其他股东过半数同意，而不是全部其他股东同意，所以B选项错误。

C选项，除公司章程另有约定外，股份有限公司可以对内部转让股权，也可以对外部转让股权，所以C选项错误。

D选项，员工收购（EBO）是指目标公司的员工集体出资将股权投资基金所持有的股权（股份）收购，从而实现股权投资基金的退出，是回购退出的一种方式，所以D选项正确。