关于厂房和仓库耐火等级的说法，不正确的有哪些？

根据题目给出的选项，关于厂房和仓库耐火等级的说法，不正确的有：

A选项：高架仓库的耐火等级不应低于二级。根据《建筑设计防火规范》和《建筑防火通用规范》，高架仓库的耐火等级不应低于二级，所以A选项是正确的。

B选项：建筑高度大于50m的高层厂房的耐火等级不应低于二级。根据《建筑防火通用规范》，建筑高度大于50m的高层厂房的耐火等级应该为一级，因此B选项是错误的。

C选项：粮食筒仓采用自动喷水灭火系统保护时，耐火等级可为三级。根据《建筑设计防火规范》，粮食筒仓的耐火等级不应低于二级，所以C选项是错误的。

D选项：储存可燃液体的多层丙类仓库的耐火等级不低于二级。根据《建筑防火通用规范》，储存可燃液体的多层丙类仓库的耐火等级应该为一级，因此D选项是错误的。

E选项：甲、乙类厂房内的防火墙，其耐火极限不应低于4．00h。根据《建筑防火通用规范》，甲、乙类厂房和甲、乙、丙类仓库内的防火墙，耐火极限不应低于4.00h，因此E选项是正确的。

综上所述，不正确的说法是BCD。