关于新建商店建筑的描述，下列说法错误的是？

根据《建筑设计防火规范》和《建筑防火通用规范》的相关规定，该商店建筑地上部分的耐火等级确实不应低于二级，所以选项A正确。对于该商店建筑地下部分，根据其埋深和层数，应设置为防烟楼梯间，而不是普通的封闭楼梯间，因此选项B是错误的。柴油发电机房的疏散门应该直通室外或安全出口，所以选项C是正确的。根据规定，消防水泵房不应设置在建筑的地下三层及以下楼层，因此选项D也是正确的。因此，本题中的错误说法是B选项。