下列哪些建筑应设置与室内消火栓等水灭火系统供水管网直接连接的消防水泵接合器？

根据《建筑防火通用规范》GB55037-2022的规定，应设置与室内消火栓等水灭火系统供水管网直接连接的消防水泵接合器的建筑包括：6层及以上并设置室内消火栓系统的民用建筑；5层及以上并设置室内消火栓系统的厂房。因此，选项A（6层的民用建筑）和选项C（5层的厂房）是正确的答案。其他选项如B、D、E没有明确指出需要设置消防水泵接合器，所以不是正确答案。