下列建筑应设置避难间的有（）。

根据建筑设计防火规范GB50016-2014（2018年版）的规定，高层病房楼应在二层及以上的病房楼层和洁净手术部设置避难间。因此选项B“5层病房楼”和选项C“5层洁净手术部”不符合题意。对于老年人照料设施，规范要求在3层及3层以上总建筑面积大于3000m²的情况下，应在二层及以上各层老年人照料设施部分的每座疏散楼梯间的相邻部位设置一间避难间。因此选项A“总建筑面积5000㎡，层数为3层的老年人照料设施”符合题意，而选项E“总建筑面积3000㎡，层数为5层的老年人照料设施”不符合题意。因此，应设置避难间的建筑为A、D。