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关于管网气体灭火系统的控制方案，正确的有：气体灭火控制器自动控制系统启动；驱动瓶机械应急操作装置应急控制系统启动；防护区外的手动控制装置手动控制系统启动；防护区外的手动控制装置手动控制系统停止。手动控制装置和手动与自动转换装置应设在防护区疏散出口的门外便于操作的地方。因此，选项A、B、D、E是正确的。而选项C“选择阀机械应急操作装置控制系统停止”不符合实际的控制方案，因此是不正确的。