消防技术服务机构对某自动喷水灭火系统进行检查，下列检查结果中，不符合现行国家标准《自动喷水灭火系统施工及验收规范》（GB502） 的有（）。

对于消防技术服务机构对某自动喷水灭火系统的检查结果，我们来逐项分析是否符合国家标准《自动喷水灭火系统施工及验收规范》（GB502）的要求：

A选项：管道吊架与末端喷头之间的距离为0.5m。根据规范，管道支架、吊架与喷头之间的距离不宜小于300mm，但末端喷头之间的距离不宜大于750mm，所以A选项是正确的。

B选项：管道穿楼板处设置的套管与管道的间隙采用不燃材料填塞密实。这是符合规范的，因为套管与管道的间隙应使用不燃材料填塞密实，以防止火灾时管道受到破坏。

C选项：管道井中配水干管与每层水平配水管采用机械三通连接。根据规范，配水干管（立管）与配水管（水平管）连接，应采用沟槽式管件，不应采用机械三通。因此，C选项是不符合规范的。

D选项：管道穿卫生间楼板处设置套管，套管顶部高出装饰地面35mm。规范中要求穿过卫生间或厨房楼板的套管，其顶部应高出装饰地面50mm，因此D选项不符合规范要求。

E选项：配水支管采用热浸镀锌钢管，管道吊架的最大间距为3m。根据规范，管道支架或吊架之间的距离应满足规范中的规定，没有明确提到最大间距为3m，但题目中的这个设置可能是符合某些特定情况下的规范的，所以E选项暂定为正确。

综上所述，不符合现行国家标准《自动喷水灭火系统施工及验收规范》（GB502）的有C选项和D选项。